Президент РФ Дмитрий Медведев своим указом утвердил описание и рисунок флага директора Федеральной службы безопасности РФ. Это сделано "в целях реализации единой государственной политики, сохранения и развития исторических традиций в области геральдики".
Согласно описанию, флаг директора ФСБ будет представлять собой "светло-зеленое прямоугольное полотнище с гюйсом (военно-морской красный флаг с синим Андреевским крестом) в крыже (часть полотнища у древка)". В нижней части правой половины полотнища расположено многоцветное изображение государственного герба РФ. Этим же указом Президент РФ утвердил описания и рисунки флага и вымпела кораблей, катеров и судов пограничных органов, а также гюйса пограничных кораблей первого и второго ранга (гюйс ежедневно поднимается на носу кораблей первого и второго рангов во время якорной стоянки).